2025 新年伊始
已经好几个月没有更新文章了，最近发生了一些事。 申博和毕业
从去年 12 月开始决定留下深造，到现在反反复复，出现了很多事。
先是快乐接受老板发来的 Offer；再到 3 月份因为申请材料中出现的瑕疵，被老板教育了一顿（我很感激，确实是我的问题）；再到 3…
重新部署 MixSpace+Shiroi
Intro 昨天刚对博客的架构进行了一波更新，今早醒来发现服务器到期了，导致网站直接 Down，甚至没有到期提醒的邮件。
本计划到期后不再续费，而到期后已经无法连接上服务器了，里面的数据也取不出来。所幸之前有良好的备份习惯，定时将数据备份到 OneDrive，具体可参见这篇文章。…
RSS 解决方案：RSSHub+WeWe RSS+FreshRSS+Reeder
Intro RSS（Really Simple Syndication 或 RDF Site Summary），是一种消息来源格式规范，用以聚合多个网站更新的内容并自动通知网站订阅者。
能看到这篇文章，想必你大概知道 RSS 是什么了，不过多赘述了。
本解决方案使用以下服务：…
使用 infuse 挂载百度网盘
TL；DR 使用 Alist 挂载百度网盘。
在 infuse 内通过 WebDAV 连接 Alist。
使用 Surge 为 ^*baidupcs.com 添加 User-Agent: pan.baidu.com。
Copy
[Header Rewrite]
http…
从 PDB 获取结构并查看密度
TL;DR 找到感兴趣的结构，这里以目前数据库中分辨率最高（0.48 Å）的结构 5D8V 为例。
下载模型和密度
PDB format 的模型
Validation 2fo-fc coefficients 文件，解压得到 cif 格式文件
Validation fo…
De novo assemble RNA-seq sequence
Intro A research paper published on biorxiv determined a new coronavirus subgenus, I would like to figure out is there any changes on…
Xia2
Note This methods is written maybe one year ago, it's published for memorandum only.
Intro
Xia2 is an expert system for automated…
图床解决方案：Cloudflare R2+PicGo+WebP Cloud
Intro 此前我的图床是基于 Cloudflare + Telegraph 这两位大善人的，我本以为他们会比我的博客活得更久，因此我默认这是一个长期的解决方案，足够可靠易用，最重要的是免费。
但最近 Telegram CEO 被捕，韩国也因为审查方面的原因和 Telegram…
丹阳
Intro 之前配的眼镜抗污能力已经很差了，随便碰一下就会影响视觉效果，同时因为保护不当出现了一些细小的划痕，因此打算重新配一副眼镜。
之前配的这副眼镜是我在 1688 配的，当时在医院做的验光，网上选了蔡司的防蓝光镜片和施洛华的纯钛镜框，总价印象中在 750 左右。
当时觉得这…
丹阳
Intro 之前配的眼镜抗污能力已经很差了，随便碰一下就会影响视觉效果，同时因为保护不当出现了一些细小的划痕，因此打算重新配一副眼镜。
之前配的这副眼镜是我在 1688 配的，当时在医院做的验光，网上选了蔡司的防蓝光镜片和施洛华的纯钛镜框，总价印象中在 750 左右。
当时觉得这…
Linux Mint & Windows 双系统远程启动
Intro 我的小服务器上安装了双系统，先安装的 Windows 再 安装的 Linux Mint，由 GRUB 进行引导，默认引导到 Linux Mint。
如果您也是这样安装的话，可以通过一下方法远程切换系统。
从任意系统重启至 Linux Mint
因为 GRUB…
aria2
Intro This method introduces how to install aria2 and configure it, and how to set a startup. Then work with Alist.
Install aria2
Install…
Color Protein Model by Sequence Conservation with ConSurf
ConSurf | Evolutionary conservation profiles of proteins, which analyze the sequence conservation of proteins and color the model by the…
Build Models for cryo-EM Maps with ModelAngelo
Intro Building a model for a huge cryo-EM map may be annoying, especially when it's supercomplex.
But now you can use ModelAngleo to build…
XDS Installation Issue on arm64 Mac
Recently I encountered an XDS installation error when processing a set of diffraction data, so I tried to reinstall the whole XDS-related…
Deploy X-Ray Data Process Software on Linux
==This note is based on Linux Mint 21.3==, it should be also useful if you running a Ubuntu. XDS Related Software
Reference：https://wiki…
星巴克臻选 上海烘焙工坊
学校书院为助力未来庭院咖啡角的建设，为同学们更好理解咖啡产业商业经营、咖啡评鉴和制作工艺，出台了这次活动。 ||（活动针对本科生，但我好像混进去了，不是）||
我们拜访的这家上海烘焙工坊是星巴克全球唯六的烘焙工坊之一，也是美国本土海外的第二家烘焙工坊。很多人称这家店为星巴克旗舰店…
PAC（Proxy Auto-Config）
有一个事情困扰了我很久： 我是一个深度的 macOS 用户，得易于 macOS 上优良的软件，例如 surge for mac，我能够很轻易的解决几乎所有网络问题。
但这个事情在 Windows 和 Linux 上就显得比较复杂，但使用 Windows 或 Linux…