夏2 - Jayden

夏2

2024年9月9日90

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AI 生成的摘要

[!注意] 此方法大约在一年前编写，仅供备忘。简介 Xia2 是一个用于自动处理大分子晶体 X 射线衍射数据的专家系统。它是开源的，源代码可以在此处获取。在我的工作流程中，Xia2 比 XDS 更易于使用。然而，Xia2 只能在命令行界面（CLI）中运行，而 XDS 有图形用户界面（XDSGUI）。使用方法您可以切换到包含图像的文件夹，并运行以下命令： xia2 pipeline=dials . 请注意，Xia2 可以利用多种管道处理您的数据，例如 dials、dials-aimless、XDS 和 XSCALE。您可以在此处找到许多参数。如果您在 SSRF 10U2 收集数据，可能还需要通过添加 goniometer.axes=0,1,0 来更改 goniometer 轴。 xia2 pipeline=dials-aimless ./ goniometer.axes=0.000000,1.000000,0.000000 xia2.settings.resolution.d_min=1.89 检查结果在运行目录中将生成一个 xia2.html 文件，其中包含摘要。

Note

这个方法大约在一年前写的，仅供备忘使用。

介绍#

Xia2 是一个用于自动减少大分子晶体 X 射线衍射数据的专家系统。它是开源的，您可以在这里获取其源代码。

在我的工作流程中，Xia2 比 XDS 使用起来要简单得多。然而，您只能在 CLI 中运行 Xia2，而 XDS 则有一个 GUI：XDSGUI。

使用方法#

您可以更改目录到包含图像的文件夹，并运行以下命令：

xia2 pipeline=dials .

请注意，Xia2 可以利用多种管道来处理您的数据，例如 dials、dials-aimless、XDS 和 XSCALE。您可以在这里找到很多参数。如果您在 SSRF 10U2 中收集数据，您可能还需要通过添加goniometer.axes=0,1,0来更改 goniometer 轴。

xia2 pipeline=dials-aimless ./ goniometer.axes=0.000000,1.000000,0.000000 xia2.settings.resolution.d_min=1.89

[!NOTE]

上述链接中的参数似乎不完整，我找不到完整的参数。但您可以参考您运行 Xia2 的目录中的 Phil 格式文件。

检查结果#

在运行目录中将生成一个 xia2.html 文件，其中包含摘要。

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