Note
この方法はおそらく 1 年前に書かれたもので、メモとしてのみ公開されています。
はじめに#
Xia2 は、マクロ分子結晶からの X 線回折データの自動還元のための専門システムです。オープンソースであり、そのソースコードはこちらから入手できます。
私のワークフローでは、Xia2 は XDS よりもはるかに使いやすいです。ただし、Xia2 は CLI でのみ実行でき、XDS には GUI があります：XDSGUI。
使用法#
画像を含むフォルダーにディレクトリを変更し、次のコマンドを実行できます：
xia2 pipeline=dials .
Xia2 は、dials、dials-aimless、XDS、XSCALE など、さまざまなパイプラインを利用してデータを処理できます。多くのパラメータはこちらで見つけることができます。SSRF 10U2 でデータを収集した場合、goniometer.axes=0,1,0を追加してゴニオメーターの軸を変更する必要があるかもしれません。
xia2 pipeline=dials-aimless ./ goniometer.axes=0.000000,1.000000,0.000000 xia2.settings.resolution.d_min=1.89
[!NOTE]
上記リンクのパラメータは完全ではないようで、完全なものを見つけることができません。しかし、Xia2 を実行するディレクトリにある Phil 形式のファイルを参照することができます。
結果の確認#
実行ディレクトリに xia2.html ファイルが生成され、要約が含まれます。
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元のリンクは https://xxu.do/posts/academic/xia2