從原始碼安裝 Clustal Omega

2024年3月7日138

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AI 生成的摘要

這個程序是基於M1 Mac的。下載源代碼並提取： wget http://www.clustal.org/omega/clustal-omega-1.2.4.tar.gz && tar -xzvf clustal-omega-1.2.4.tar.gz && cd clustal-omega-1.2.4 使用Homebrew安裝argtable：如果您尚未安裝Homebrew，您需要先安裝它。 /bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)" brew install argtable 編譯並安裝： ./configure CFLAGS='-I/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/include' LDFLAGS='-L/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/lib' make make install 檢查安裝情況： which clustalo 然後您可以使用以下命令： cd /path/to/your/sequence clustalo -i sequence.fasta -o output.fasta --seqtype=protein

這個程序是基於 M1 Mac。

下載源代碼並解壓縮：

wget http://www.clustal.org/omega/clustal-omega-1.2.4.tar.gz && tar -xzvf clustal-omega-1.2.4.tar.gz && cd clustal-omega-1.2.4

使用 Homebrew 安裝 argtable：

# 如果你還沒有安裝 Homebrew，你需要先安裝它。
/bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"

brew install argtable

編譯並安裝：

./configure CFLAGS='-I/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/include' LDFLAGS='-L/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/lib'
make
make install

檢查安裝情況：
```
which clustalo
```

然後你可以使用以下命令：

cd /path/to/your/sequence
clustalo -i sequence.fasta -o output.fasta --seqtype=protein

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原始連結為 https://xxu.do/posts/academic/Install-Clustal-Omega-from-source-code