ソースコードからClustal Omegaをインストールする

2024年3月7日138

AI 翻訳

この記事はAIを通じて英語から日本語に翻訳されました。原文を表示

AI が生成した要約

"Ja, M1 Mac ni motozuku shisutemu desu. Sōsu kōdo o shūshutsu shite kudasai: wget http://www.clustal.org/omega/clustal-omega-1.2.4.tar.gz && tar -xzvf clustal-omega-1.2.4.tar.gz && cd clustal-omega-1.2.4 Homebrew de argtable o insutōru shimasu: Homebrew o mada insutōru shite inai baai wa, kōre o insutōru suru hitsuyō ga arimasu. /bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)" brew install argtable Kōsaku to insutōru: ./configure CFLAGS='-I/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/include' LDFLAGS='-L/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/lib' make make install Insutōru o kakunin shimasu: which clustalo Soshite, kore o tsukatte: cd /path/to/your/sequence clustalo -i sequence.fasta -o output.fasta --seqtype=protein"

この手順は M1 Mac に基づいています。

ソースコードをダウンロードして展開します：

wget http://www.clustal.org/omega/clustal-omega-1.2.4.tar.gz && tar -xzvf clustal-omega-1.2.4.tar.gz && cd clustal-omega-1.2.4

Homebrew を使用して argtable をインストールします：

# Homebrewをインストールしていない場合は、まずHomebrewをインストールする必要があります。
/bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"

brew install argtable

コンパイルしてインストールします：

./configure CFLAGS='-I/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/include' LDFLAGS='-L/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/lib'
make
make install

インストールを確認します：
```
which clustalo
```

次に、次のコマンドを使用してそれを使用できます：

cd /path/to/your/sequence
clustalo -i sequence.fasta -o output.fasta --seqtype=protein

この文書は Mix Space からの同期更新で、xLog にも掲載されています。
元のリンクは https://xxu.do/posts/academic/Install-Clustal-Omega-from-source-code です。